Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP1P29466 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP1P29466 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP1P29466 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP1P29466 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP1P29466 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms