Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA1P15976 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA1P15976 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATA1P15976 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA1P15976 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA1P15976 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms