Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA4O75335 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA4O75335 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIA4O75335 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms