Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LANCL1O43813 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LANCL1O43813 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms