Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
B4DEV8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B4DEV8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B4DEV8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B4DEV8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B4DEV8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B4DEV8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms