Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TCRBV7S3A2A0A539 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TCRBV7S3A2A0A539 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TCRBV7S3A2A0A539 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TCRBV7S3A2A0A539 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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