Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK3Q9Y2K2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms