Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SPTAN1-206ENST00000475367 2237 ntTSL 210.65□□□□□ -0.712e-7■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SERPINA5-207ENST00000554760 1113 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-12■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SERPINA5-204ENST00000554220 586 ntTSL 49.74□□□□□ -0.851e-12■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SERPINA5-212ENST00000556775 829 ntTSL 59.74□□□□□ -0.851e-12■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 29.59□□□□□ -0.877e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 CPSF1-203ENST00000527916 506 ntTSL 59.39□□□□□ -0.917e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-7■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SERPINA5-213ENST00000557598 607 ntTSL 28.23□□□□□ -1.091e-12■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 SPTAN1-215ENST00000628867 579 ntTSL 26.61□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 35.54□□□□□ -1.527e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 33.3□□□□□ -1.887e-6■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-13■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-13■□□□□ 9.2
NOL12Q9UGY1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.317e-18■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 GSN-211ENST00000477553 680 ntTSL 212.2□□□□□ -0.468e-26■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CALR-206ENST00000588454 776 ntTSL 310.33□□□□□ -0.767e-18■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 210.23□□□□□ -0.777e-18■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-25■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PTPRF-203ENST00000372407 4600 ntTSL 212.98□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.941e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-208ENST00000620376 1984 ntTSL 223.72■■□□□ 1.391e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-201ENST00000451864 1927 ntTSL 222.64■■□□□ 1.211e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PROC-204ENST00000419985 500 ntTSL 420.36■□□□□ 0.851e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-205ENST00000612897 1862 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.681e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PROC-208ENST00000442644 600 ntTSL 318.2■□□□□ 0.51e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PKD1P5-202ENST00000538166 606 ntTSL 317.79■□□□□ 0.441e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-211ENST00000598240 3235 ntTSL 217.41■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CCNL2-206ENST00000463260 1941 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.182e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-207ENST00000618120 2424 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-206ENST00000613460 1912 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 C3-209ENST00000597442 469 ntTSL 313.33□□□□□ -0.281e-43■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-209ENST00000622297 720 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 RHBG-203ENST00000494874 324 ntTSL 311.05□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-20■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 C3-203ENST00000594270 349 ntTSL 58.78□□□□□ -11e-43■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CP-210ENST00000481169 3411 ntTSL 27.7□□□□□ -1.181e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CP-211ENST00000489736 1756 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.521e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CP-213ENST00000494544 2806 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CP-212ENST00000490639 3105 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-18■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 216.95■□□□□ 0.33e-76■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 315.84■□□□□ 0.133e-76■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-76■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 24.54□□□□□ -1.683e-76■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.63e-76■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.679e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.79e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.779e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.184e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.654e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 36.23□□□□□ -1.414e-8■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-215ENST00000621029 934 ntTSL 526.56■■□□□ 1.842e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 523.24■■□□□ 1.312e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 AGFG2-204ENST00000474713 1864 ntTSL 519.48■□□□□ 0.712e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-211ENST00000612509 1061 ntTSL 517.07■□□□□ 0.322e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 AGFG2-202ENST00000429987 928 ntTSL 316.68■□□□□ 0.262e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 515.8■□□□□ 0.126e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 515.02■□□□□ -06e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 MST1-217ENST00000493836 923 ntTSL 213.25□□□□□ -0.292e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SEZ6L2-205ENST00000562159 764 ntTSL 313.21□□□□□ -0.292e-10■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 312.47□□□□□ -0.416e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.927e-7■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.486e-12■□□□□ 9.1
NOL12Q9UGY1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.843e-7■□□□□ 9
NOL12Q9UGY1 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 9
NOL12Q9UGY1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.611e-6■□□□□ 9
NOL12Q9UGY1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.611e-6■□□□□ 9
NOL12Q9UGY1 MYH9-211ENST00000495928 329 ntTSL 210.25□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 9
NOL12Q9UGY1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.562e-11■□□□□ 9
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 215.2 ms