Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRN3Q9NYV6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRN3Q9NYV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRN3Q9NYV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms