Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms