Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms