Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.7 ms