Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCTD12Q96CX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms