Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFT1Q96AA3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms