Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLNKQ7Z7G1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms