Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms