Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1DQ13901 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1DQ13901 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1DQ13901 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
C1DQ13901 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1DQ13901 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1DQ13901 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1DQ13901 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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