Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAGPQ0VAQ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms