Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDR1Q08345 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms