Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBX1P62877 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBX1P62877 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms