Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms