Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBASH3AP57075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms