Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMSP52788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMSP52788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMSP52788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMSP52788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMSP52788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMSP52788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMSP52788 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMSP52788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMSP52788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMSP52788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMSP52788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMSP52788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms