Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E2P29084 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms