Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GM2AP17900 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GM2AP17900 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GM2AP17900 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GM2AP17900 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GM2AP17900 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GM2AP17900 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms