Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEFHP12036 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEFHP12036 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEFHP12036 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEFHP12036 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEFHP12036 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms