Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CALM3P0DP25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALM3P0DP25 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms