Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2BP0C7M4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2BP0C7M4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms