Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDHAP00338 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDHAP00338 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDHAP00338 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHAP00338 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHAP00338 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms