Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPINK4O60575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINK4O60575 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms