Protein–RNA interactions for Protein: A6NED7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NED7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
A6NED7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
A6NED7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
A6NED7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
A6NED7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms