Protein–RNA interactions for Protein: A6NED7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NED7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A6NED7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A6NED7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A6NED7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NED7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NED7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NED7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A6NED7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A6NED7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A6NED7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NED7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NED7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NED7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A6NED7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A6NED7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NED7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NED7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NED7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NED7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NED7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NED7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NED7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NED7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A6NED7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NED7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NED7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A6NED7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NED7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NED7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NED7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NED7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NED7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NED7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NED7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NED7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NED7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A6NED7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NED7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NED7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A6NED7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A6NED7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A6NED7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NED7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NED7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
A6NED7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A6NED7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A6NED7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A6NED7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A6NED7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
A6NED7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NED7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A6NED7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NED7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A6NED7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A6NED7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A6NED7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A6NED7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NED7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NED7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NED7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NED7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NED7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NED7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NED7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A6NED7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A6NED7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A6NED7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A6NED7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A6NED7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A6NED7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NED7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A6NED7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A6NED7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NED7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NED7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NED7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NED7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NED7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NED7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NED7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NED7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A6NED7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A6NED7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A6NED7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
A6NED7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A6NED7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A6NED7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A6NED7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A6NED7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A6NED7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A6NED7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NED7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NED7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NED7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NED7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NED7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NED7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NED7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NED7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NED7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1142.6 ms