Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GJA3Q9Y6H8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJA3Q9Y6H8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GJA3Q9Y6H8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
GJA3Q9Y6H8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
GJA3Q9Y6H8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA3Q9Y6H8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA3Q9Y6H8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GJA3Q9Y6H8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJA3Q9Y6H8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJA3Q9Y6H8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.7 ms