Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARFGEF1Q9Y6D6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARFGEF1Q9Y6D6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF1Q9Y6D6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARFGEF1Q9Y6D6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARFGEF1Q9Y6D6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARFGEF1Q9Y6D6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARFGEF1Q9Y6D6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARFGEF1Q9Y6D6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms