Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP4B1Q9Y6B7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP4B1Q9Y6B7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP4B1Q9Y6B7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4B1Q9Y6B7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP4B1Q9Y6B7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
AP4B1Q9Y6B7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4B1Q9Y6B7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP4B1Q9Y6B7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms