Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHGB2Q9Y5G2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHGB2Q9Y5G2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHGB2Q9Y5G2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHGB2Q9Y5G2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHGB2Q9Y5G2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHGB2Q9Y5G2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHGB2Q9Y5G2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms