Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHB1Q9Y5F3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB1Q9Y5F3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB1Q9Y5F3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB1Q9Y5F3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB1Q9Y5F3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB1Q9Y5F3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB1Q9Y5F3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB1Q9Y5F3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB1Q9Y5F3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms