Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPEF1Q9Y4P9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPEF1Q9Y4P9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPEF1Q9Y4P9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPEF1Q9Y4P9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPEF1Q9Y4P9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms