Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFE2L3Q9Y4A8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFE2L3Q9Y4A8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFE2L3Q9Y4A8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFE2L3Q9Y4A8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFE2L3Q9Y4A8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFE2L3Q9Y4A8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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