Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNIP3Q9Y2W7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNIP3Q9Y2W7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms