Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIKFYVEQ9Y2I7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIKFYVEQ9Y2I7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIKFYVEQ9Y2I7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIKFYVEQ9Y2I7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIKFYVEQ9Y2I7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms