Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCE1Q9Y256 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCE1Q9Y256 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCE1Q9Y256 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RCE1Q9Y256 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCE1Q9Y256 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCE1Q9Y256 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCE1Q9Y256 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms