Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNRC6BQ9UPQ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRC6BQ9UPQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6BQ9UPQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNRC6BQ9UPQ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNRC6BQ9UPQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms