Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NWD2Q9ULI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NWD2Q9ULI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NWD2Q9ULI1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NWD2Q9ULI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NWD2Q9ULI1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD2Q9ULI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NWD2Q9ULI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD2Q9ULI1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD2Q9ULI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD2Q9ULI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD2Q9ULI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD2Q9ULI1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD2Q9ULI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NWD2Q9ULI1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NWD2Q9ULI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NWD2Q9ULI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NWD2Q9ULI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NWD2Q9ULI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NWD2Q9ULI1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NWD2Q9ULI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms