Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PNMA2Q9UL42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PNMA2Q9UL42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNMA2Q9UL42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA2Q9UL42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PNMA2Q9UL42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PNMA2Q9UL42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PNMA2Q9UL42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PNMA2Q9UL42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PNMA2Q9UL42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PNMA2Q9UL42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PNMA2Q9UL42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms