Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRNDQ9UKY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRNDQ9UKY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRNDQ9UKY0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRNDQ9UKY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRNDQ9UKY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRNDQ9UKY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRNDQ9UKY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRNDQ9UKY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRNDQ9UKY0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRNDQ9UKY0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRNDQ9UKY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms