Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM4Q9UKN5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM4Q9UKN5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM4Q9UKN5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM4Q9UKN5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM4Q9UKN5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM4Q9UKN5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRDM4Q9UKN5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms