Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APPL1Q9UKG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APPL1Q9UKG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APPL1Q9UKG1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APPL1Q9UKG1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APPL1Q9UKG1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APPL1Q9UKG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APPL1Q9UKG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APPL1Q9UKG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APPL1Q9UKG1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APPL1Q9UKG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APPL1Q9UKG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APPL1Q9UKG1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms