Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1Q9UJJ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPUSD1Q9UJJ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPUSD1Q9UJJ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1Q9UJJ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPUSD1Q9UJJ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD1Q9UJJ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPUSD1Q9UJJ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms