Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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